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转化生物医学信息学

荣蓉

2020-04-08 16:25:44

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什么是转化生物医学信息学？

南加州大学keck医学院成立于1885年，是南加州地区成立的第一所、历史最为悠久的医学院，也是在usc成立的第二所职业导向学院，有着悠久的创新和社区服务传统。

显著成就
▷ 1970年成立美国首个急诊医学院
▷ 首个为第一年的医学生提供患者护理方面的实际经验
▷ 率先使用“标准化患者”进行医学培训
▷ 开发hte @ usc的医学和工程学跨学科项目，寻找解决现实世界医疗问题的方案

转化生物医学信息学

keck医学院的转化基因组系于2017年开始为学生提供转化生物医学信息学硕士学位（ms in translational biomeical informatics）。这个为期两年的强化硕士课程面向具有强大生物医学实验室背景的学生，培养他们分析、处理和管理大规模数据的技能。毕业生将去往学术研究实验室、临床研究实验室、制药公司和生物技术公司担任应用生物信息学家。

该项目在keck医学院授课。学生不仅需要通过线上学习和培训生物信息课程，也需要在线下课堂环境中亲自参加课程。大多数课程大量使用在线内容和资源，学生应当配备最新版本的 macbook或macbook pro笔记本电脑。

课程设置
核心课程
转化生物医学信息学基础
人类基因组分析方法介绍
高级人类基因组分析方法
应用转化生物基因组数据库与数据结构
基因组技术在生物医学研究中的应用i
基因组技术在生物医学研究中的应用ii
转化生物医学信息学作品集
选修课程
生物技术的基础、概念、核心原则ii
人类遗传学的统计方法
生物医学信息学导论
医疗诊断、治疗和信息学
信息学编程原理
大数据环境中的数据信息学概述
神经影像与系统神经科学
神经影像数据处理方法
　目标学生　
该项目提供生物医学方向的应用生物信息学培训。该项目适合具有生物医学实验室工作经验背景的学生。学生应当理解实验目的、如何建立假设和检验假设。虽然学生可以在项目要求外选修其他学院提供的数据统计课程，但申请人需要已经在以往的课程学习中了解了生物统计学。
　项目亮点　
该项目旨在应用生物医学信息学来研究人类健康和疾病。为了从事从研究到临床的各类职业：
学生应当理解他们在监管机构范围内处理和应用数据的关键角色。
学生将学习：
✰ 他们在数据管理和分享中的角色、如何与实验团队合作互动、如何使他人能够以灵活和交互的方式使用数据集、项目管理、最佳实践和版本控制技能；
✰ 成为工程师和生物学家之间的联络员，负责制定规范和标准操作程序。
通过该项目，学生将获得如下技能：
•将现有工具和信息数据集合在一起，以更好地理解生物医学问题;
•下一代测序（ngs）分析，包括全基因组，外显子组和转录组测序（rna-seq），以及新兴的单细胞测序方法;
•项目管理和需求收集技能，使相关人员能够与计算和工程专业知识进行交互和互动，以帮助设计解决方案;
•利用现代框架进行快速原型设计的经验，以及如何从各种数据库中提取信息;
•公开数据库和保密数据库的数据安全、隐私和数据共享。