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ECU生物信息硕士 | 掌握基因测序

朱榕
2020-03-20 14:11:29
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ECU生物信息硕士 | 掌握基因测序,破译病毒密码

在前所未知的新型冠状病毒袭来之际,全球科学界携手迎战这个人类共同的敌人。医生与护士,这些我们熟知的白衣天使在第一线“战疫”的同时,另一场围绕着“病毒解码”的战争也在如火如荼地进行着,同时也让一个神秘的专业进入了大众的视角。

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各路专业人士可谓是八仙过海,各显神通

埃迪斯科文大学于2020年新增黑科技硕士专业“生物信息学(Bioinformatics)”,这门交叉科学综合运用数学、计算机科学和生物学的各种工具,来阐明和理解大量生物数据所包含的生物学意义。作为该专业的重要应用之一,“基因组测序技术”,在目前日益严峻的疫情防控中,起着至关重要的作用。

什么是生物信息学?

bio + informatics = bioinformatics

海量的生物数据只有经过信息学手段进行收集,分析和整理后,才能成为有用的知识和信息。

生物信息学已成为当今世界科学的流行语。十年前,人们将生物学和计算机科学视为两个完全不同的领域。前者可以了解生物及其功能,而后者可以了解计算机和基础理论,这两个领域之间似乎没有交集。然而,这个新领域 - 生物信息学 ,是计算机科学和生物学的完美结合。

这种学科的结合也是一种必然趋势。随着1990年人类基因组计划(Human Genome Project)的实施和信息技术的发展,各种生物分析导致“遗传数据爆炸”,从而产生数量的生物数据,而使用手动方法分析它们变得非常困难,这就是计算机科学可以拯救的方面。各种计算技术用于通过自动化过程更准确和有效地分析生物数据,因此, 生物信息学可以被认为是用数据科学技术来解决医学问题的学科。 现已迅速发展成为当今生命科学最具吸引力的、重大的前沿领域。生物信息学为生物学、计算机科学、数学、信息科学等专业的高素质人才提供了更广阔的发展天地。

为什么要研究生物信息学?

生物信息学的主要应用可以在 精准医学和预防医学 领域中找到。精准医学包括为个别患者定制的医疗保健技术,包括治疗和实践,发现个体的模式从而提高医疗水平。

生物信息学已被证明拥有巨大的潜力,以事先确定疾病,确定治疗和帮助人类生活更加美好。凭借计算机科学的灵感和知识,基因技术,医学和医疗保健等领域可以从治疗个体患者到治愈整个人群。

生物信息学发展现状

如今,很多生物医药学的研究机构都在产生海量的数据,而且希望通过计算生物学家来弄懂这些数据。因为完成一项大数据产出的实验课题,必然需要耗费大量的心血和资金投入,但是如果不能分析、了解这些数据背后的意义,那工作不能算真正完成。

因此,生物医学研究的未来不仅依赖于可以设计出优秀实验并产生高质量数据的实验生物学家,还要依赖于会对产生的数据进行有效分析挖掘的计算生物学家。

ECU生物信息学硕士详解

课程内容

生物信息学是新兴的生物科学学科,被普遍认为是生物研究的前沿。近五年来,其专业就业机会显著增加。

本课程为学生提供 生物信息学方面的技能和行业内相关组织的工作经验 ,让学生了解生物信息学在现实世界中的应用。它还聚焦于 生物信息学研究人员和行业专业人员的实践技能 ,为学生提供生物信息学方面的技能和经验,重点是解剖学科学、计算机程序设计、应用数学和统计学。该学位的毕业生将对生物信息学有一个良好的 实践和理论 理解。这门学科在分子生物学、化学、数据科学和临床研究等领域,在 科学学院和医学与健康科学院 各自的,以及两所学院合作的研究项目中的重要性不断提高。

该学位通过为毕业生提供生物信息学方面的知识和技能,并通过课程作业和实习项目,提高学生在当前就业市场上的竞争力,使他们了解当代实践中使用的一些现有和新兴的分析工具。

实习机会

学生需要在实习单位、大学进行至少10周的全职工作实习或研究项目。国际学生要满足全日制注册要求,所以要在学校完成科研项目,或者在本地公司完成实习。接受工作安排的学生将展示纪律知识、沟通和协作技能,建立职场人脉,从而提高就业竞争力。

就业方向

学生将能够在地方政府、行业、州、国家政府和非政府组织,特别是生物、医疗和研究部门就业。工作岗位包括生物信息学家、计算生物学家、计算化学家、计算科学家、系统生物学家、临床生物信息学家、数据科学家、数据分析师、信息学家、生物特征学家。

课程设置

学习内容详解

生物统计学

课程目标: 了解生物统计学基本原理,能使用统计分析软件进行基础的生物信息分析,并且能对健康与医学领域的相关文献进行批判性评估。

学习内容: 掌握SPSS软件,变量分析,卡方检验,逻辑回归,非参数统计,线性回归等。

编程原理

课程目标: 了解编程语言的基本语法,侧重于培养设计与运行程序来解决实际问题的能力。

内容包括:数据类型与选择,数据结构,函数与建模,字符串与集合,文档读写与意外处理,面向对象编程概论,可视化界面,测试与质量控制。

数据分析和可视化

该课程介绍如何针对大量复杂的数据集合,进行不同的种类的可视化处理。并且对比各类机器学习方法论的优势与劣势,让学生可以根据不同的应用场景选择最优的机器算法。

分子生物学与基因组学

课程目标: 了解分子生物学及基因组学基本概念,知识点与前沿发展趋势。了解基因测序技术及应用。

内容包括:糖基组学,蛋白组学,代谢组学理论与应用,基因组学技术与应用,基因组测序,基因组序列对比与进化,共享软件的应用(Chromas Lite、Blast、Gene i、Genbank、ncbi)。

生物数据库和数据挖掘

该课程介绍糖基组,基因组,蛋白质组与代谢组等常见的生物数据库,学生利用编程的手段进行数据整合,从而挖掘出创新的,有意义的生物学信息与知识。内容包括:线上生物数据库资源介绍,数据提取原理,计算机数据提取工具,数据清理与整理,组学数据映射。

系统生物学中的质谱学

该课程介绍高像素质谱分析法在蛋白组学与代谢组学中的实际应用。内容包括:高像素质谱分析法,光谱预处理,特征分析,质量评估与检测,实验报告。

研究准备:原则和方法

课程目的:熟悉基本学术道德规范,掌握SCI论文撰写的基本要素和技巧,为能够独立撰写相关研究论文打好基础。

内容包括:沟通技巧,研究框架,提出假设,研究学习评估标准,批判性思维,研究设计,研究流程与文献引用,定性与定量研究方法。

综合系统生物学

课程目的:掌握常用在线生物信息分析工具和数据库的本地化与使用方法,包括梳理和整合不同组学平台上的数据,其中包括基因组,转录组,蛋白组,和代谢组等,从而形成本地生物样本库。

内容包括:组学数据整理,组学平台数据建模与统计分析,关联法数据整合,多元统计法数据整合等。

临床生物信息学

课程目的:掌握R语言基本语法,能够利用R语言进行基本的统计分析,数据可视化和独立脚本工具开发。为前沿的科学知识与临床数据搭建了一座桥梁,培养学生利用生物信息学技能去分析临床数据库的能力。

内容包括:统计软件的高级运用(R语言),临床数据分析等。

实习项目

学生需要在实习单位、大学进行至少10周的全职工作实习或研究项目。国际学生要满足全日制注册要求,所以要在学校完成科研项目,或者在本地公司完成实习。接受工作安排的学生将展示纪律知识、沟通和协作技能,建立职场人脉,从而提高就业竞争力。

ECU生物信息学硕士优势

No.1

创新的前沿课程

西澳唯一的生信硕士课程, 澳洲只有不超过五所大学有开设 ;中国也只有中国科学院大学,复旦大学,浙江大学等极少院校开设。

No.2

中国顶级的实习基地

最后一年,学生有机会被安排去上海市临床生物信息研究所-复旦大学附属中山医院进行项目实习。

No.3

入读博士的最佳途径

ECU导师优先考虑本校的硕士毕业生,可以推荐申请 ECU-中国国家留学基金委联合奖学金 。详情点击参考:

ECU和中国名校联合申报“医学组学与大数据分析研究创新型人才国际合作培养项目”成功获批

No.4

与中国高校的合作

近几年来,国内对生物信息学研究和应用越来越重视,北京大学和中科院上海生命科学研究院均先后建立了生物信息学中心,分别维护着国内两个专业水平较高的生物信息学网站。由于起步较晚,与国际发达国家相比,在人力与财力投入上明显不足,生物信息学研究与应用整体情况来看,仍然与国际先进水平有较大差距。

目前中科院和国内一些知名大学已经开始寻找大规模培养生物信息学的专业人才的模式,与 国外高专业水平的高校的联合培养与合作是重中之重 。ECU生物信息学刚刚确认2020年2月开始招生,就吸引了众多中国重点院校的眼球,其中获批的几个重点项目包括:

2018年,ECU与首都医科大学,北京协和医院、北京大学、中国人民大学和复旦大学联合,成功申报了《创新型人才国际合作培养项目》,每年选拔11位基因组学,蛋白组学,代谢组学,糖基组学和医学大数据分析研究方向的博士生,到澳大利亚埃迪斯科文大学(ECU)进行学习。项目获批三年(2019-2021),预计派出总人数达33名。

2019年,汕头大学医学院与ECU签署博士生联合培养项目协议,预计派出总人数达20名,专业领域包括医学,公共卫生,护理,康复医学等。

职业前景

生物信息学是二十一世纪最具发展前景的专业之一 ,学生毕业后可在 高校和科研院所 从事生物信息相关的研究和教育工作,各级政府及其下属单位从事生物信息和基因产品的行政管理工作,能在相关行业的企事业部门从事与生物信息有关的应用研究、软件开发、生产管理、技术推广等工作。工作岗位包括生物信息学家、计算生物学家、计算化学家、计算科学家、系统生物学家、临床生物信息学家、数据科学家、数据分析师、信息学家、生物特征学家。

据澳大利亚权威机构Pay scale和Seek显示,数据科学专家的 平均年薪高达$95,342甚至刚入行的科研助理就达到了 85K 以上的收入

入学要求

英语要求

雅思总分6.5,单项不低于6.0,没有达到直读的要求可以打包语言桥梁课程。

学术要求

学士学位或等同学力,不要求本科专业背景,但希望学生至少有计算机,统计学、生物学其中个方向的相关背景。

入学时间

2月,7月

学制

两年

学费

AUD$32,150/年

奖学金

2020年入学的中国学生可以享受第一年学费20%减免,减免后为$25,720澳元/年 

   

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