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计算机科学（简称CS) : 主要是从计算机计算的角度，研究计算的算法、可计算性与编程语言等等。它更像是一门科学，侧重计算原理、算法等理论学习。数学与逻辑在这个专业里更加重要。在操作层面，CS偏重对算法，各种语言，程序设计和计算的要求。
计算机工程(简称CE) : 一般指计算机硬件的开发。从计算机工程设计的角度，研究电路、电子、VLSI设计等等，是一门偏应用的学科，性质是工科。在操作层面，CE的学生，除了要掌握编程相关的技巧外，对于电子工程方面的知识也要熟悉，特别是电路，电子学，VLSI设计等等。从这个角度来看，它也可以看作是CS与电子工程（EE）专业的结合。
这两个专业确实是比较像的， 这两个专业都要求学生学习编程和软件开发的课程。
常规情况下，我们可以说两者的区别是：
CE的学生拥有对电路、电子学和VLSI设计的非常深厚的认知，而这些都是现代计算机实际结构中至关重要的。
CS的学生学习的是代数、计算和编程语言，这些构成了高级程序设计和计算的基础。
广义的CE就是应用性计算机相关的，CS会更理论一些，但是核心都是计算机。
另外，学CS的人大都去了像微软IBM，谷歌百度，脸书等等软件开发公司。 学CE的人大都去了英特尔，苹果黑莓，思科华为等硬件设计生产企业。
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马天娇
