日本的高等教育机构根据设立主体的不同，可以分为国立、公立、私立三种。

大学里的“大学院”是实施研究生教育的机构，有硕士（学制2年）、博士（学制3年）学位授予权。有些学校硕士课程和博士课程分别设立，有些学校是合在一起设立，分博士课程前期2年，博士课程后期3年，前期课程2年也视为硕士课程。

“学部”是实施本科教育的机构，有学士学位授予权。本科一般4年，医科6年（含牙医、兽医，毕业后可直接报考4年制博士研究生课程）。

短期大学和高等专门学校只能实施大学专科教育，学制2-3年，颁发专科毕业证书，不能授予学位。

在学部和大学院里，除攻读学位的正规学生外，还有“旁听生”、“履修生”和“进修生”。这三类学生都不能获得毕业证书或学位证书，只有“履修生”修读的学分被承认。学部不招收“研究生”。

日文名称
中文名称

釧路公立大学
钏路公立大学

公立はこだて未来大学
公立函馆未来大学

札幌医科大学
札幌医科大学

札幌市立大学
札幌市立大学

名寄市立大学
名寄市立大学

青森県立保健大学
青森县立保健大学

青森公立大学
青森公立大学

岩手県立大学
岩手县立大学

宮城大学
宫城大学

秋田県立大学
秋田县立大学

国際教養大学
国际教养大学

山形県立保健医療大学
山形县立保健医疗大学

会津大学
会津大学

福島県立医科大学
福岛县立医科大学

茨城県立医療大学
茨城县立医疗大学

群馬県立県民健康科学大学
群马县立县民健康科学大学

群馬県立女子大学
群马县立女子大学

高崎経済大学
高崎经济大学

前橋工科大学
前桥工科大学

埼玉県立大学
埼玉县立大学

産業技術大学院大学
产业技术大学院大学

首都大学東京
首都大学东京

神奈川県立保健福祉大学
神奈川县立保健福祉大学

横浜市立大学
横滨市立大学

新潟県立看護大学
新潟县立看护大学

富山県立大学
富山县立大学

石川県立大学
石川县立大学

石川県立看護大学
石川县立看护大学

金沢美術工芸大学
金泽美术工艺大学

福井県立大学
福井县立大学

都留文科大学
都留文科大学

山梨県立大学
山梨县立大学

長野県看護大学
长野县看护大学

岐阜県立看護大学
岐阜县立看护大学

岐阜薬科大学
岐阜药科大学

情報科学芸術大学院大学
情报科学艺术大学院大学

静岡県立大学
静冈县立大学

愛知県立大学
爱知县立大学

愛知県立芸術大学
爱知县立艺术大学

名古屋市立大学
名古屋市立大学

三重県立看護大学
三重县立看护大学

滋賀県立大学
滋贺县立大学

京都市立芸術大学
京都市立艺术大学

京都府立大学
京都府立大学

京都府立医科大学
京都府立医科大学

大阪市立大学
大阪市立大学

大阪府立大学
大阪府立大学

神戸市外国語大学
神户市外国语大学

神戸市看護大学
神户市看护大学

兵庫県立大学
兵库县立大学

奈良県立大学
奈良县立大学

奈良県立医科大学
奈良县立医科大学

和歌山県立医科大学
和歌山县立医科大学

島根県立大学
岛根县立大学

岡山県立大学
冈山县立大学

尾道大学
尾道大学

県立広島大学
县立广岛大学

広島市立大学
广岛市立大学

下関市立大学
下关市立大学

山口県立大学
山口县立大学

香川県立保健医療大学
香川县立保健医疗大学

愛媛県立医療技術大学
爱媛县立医疗技术大学

高知女子大学
高知女子大学

北九州市立大学
北九州市立大学

九州歯科大学
九州齿科大学

福岡県立大学
福冈县立大学

福岡女子大学
福冈女子大学

長崎県立大学
长崎县立大学

熊本県立大学
熊本县立大学

大分県立看護科学大学
大分县立看护科学大学

宮崎県立看護大学
宮崎县立看护大学

宮崎公立大学
宮崎公立大学

沖縄県立看護大学
冲绳县立看护大学

沖縄県立芸術大学
冲绳县立艺术大学

高知工科大学（2009年4月前为私立大学）
高知工科大学（2009年4月前为私立大学）